Pacific Biosciences of California, Inc.
Software-Upgrade von Pacific Biosciences verbessert die De-novo-Assemblierung von Genomen, das Varianten-Calling und die cDNA-Transkriptionsanalyse
Pacific Biosciences of California, Inc. 30.01.2013 00:29 --------------------------------------------------------------------------- MENLO PARK, Kalifornien, 2013-01-30 00:29 CET (GLOBE NEWSWIRE) -- Pacific Biosciences of California, Inc. (Nasdaq:PACB), Anbieter des PacBio(R) RS High Resolution Genetic Analyzer, gab heute die Veroffentlichung eines neuen Software-Upgrades bekannt, das neben anderen wichtigen Funktionen Genom-Assemblierungen von hoherer Qualitat mit nahezu perfekter Genauigkeit auf der Basenebene bietet. Das Software-Upgrade erweitert den Umfang an Projekten, die auf einzigartige Weise von der SMRT(R)-DNA-Sequenzierungsmethode (Single Molecule, Real-Time) des Unternehmens profitieren, und wird den Kunden am 31. Januar zum Herunterladen zur Verfugung stehen. SMRT Analysis 1.4 umfasst einen neuen, hierarchischen De-novo-Genomassemblierungsprozess (HGAP), der Forschern erlaubt, ganze mikrobielle und Pilzgenome nur mit PacBio-Long-Reads zu assemblieren. Infolgedessen konnen die Benutzer mit einer einzigen Bibliothekenpraparierung und weniger SMRT(R)-Zellen bessere Assemblierungen als bei fruheren Ansatzen generieren, die ausserdem Sequenzierungstechnologien mit kurzen Reads oder eine zirkulare Konsensussequenzierung erforderten. SMRT Analysis 1.4 enthalt zudem einen neuen Multi-Read-Konsensusalgorithmus mit der Bezeichnung Quiver, um die fertige Genomsequenz mit aussergewohnlicher Genauigkeit zu ermitteln. Quiver bietet sowohl fur die Resequenzierung als auch fur die De-novo-Assemblierungsanwendungen eine Konsensusgenauigkeit von mehr als 99,999 %. 'Die extra langen Sequenz-Reads und die sich daraus ergebende hohe Genauigkeit der De-novo-Assemblierungen, die durch die aktuellen Softwareneuerungen von PacBio RS erzielt werden, haben unsere Fahigkeit, neuartige Genome kosteneffizient zu entdecken und zu verstehen, ungemein erhoht', sagte J. Craig Venter, Ph.D., Grunder, Vorsitzender und Chief Executive Officer am The J. Craig Venter Institute und CEO von Synthetic Genomics. Das Software-Upgrade unterstutzt das Analysieren von cDNA-Transkriptionen in voller Lange, vereinfacht das Verstandnis fur die Transkription, die Genstruktur und alternatives Spleissen. Im Gegensatz zu anderen Sequenzierungstechnologien kann die SMRT-Sequenzierung komplette cDNA-Transkriptionen mit einem einzigen Read umfassen, wodurch die komplette exonische Struktur der Transkriptionen offengelegt wird. Zu den zusatzlichen Funktionen des neuen SMRT Analysis 1.4-Upgrades gehoren: - Unterstutzung fur die Analyse barcodierter Proben; - Verbesserungen an den Tools zum Analysieren und Visualisieren bakterieller Methylome, eine einzigartige Fahigkeit der SMRT-Sequenzierung; - Erweiterte Benutzer- und Gruppenberechtigungen, damit Sequenzierungszentren und Referenzlabore festlegen konnen, welche Daten den Endbenutzern prasentiert werden sollen. 'Wir fuhlen uns dazu verpflichtet, die Leistung von PacBio RS kontinuierlich zu verbessern, unter anderem auch durch Erweiterungen der Software, damit die einzigartigen Merkmale unseres Systems noch besser zum Tragen kommen', sagte Kevin Corcoran, Senior Vice President des Market Development bei Pacific Biosciences. 'Durch lange Sequenz-Reads, richtungsweisende Genauigkeit und Assemblierungen in hoherer Qualitat kann die Genom-Community uber die SMRT-Sequenzierung die Vorteile wirklich fertiger Genome nutzen.' Das neue Upgrade der SMRT-Analysesoftware steht zusammen mit Beispieldaten und Protokollen fur die cDNA-Probenpraparierung und Barcodierung auf der Community-Website von Pacific Biosciences zur Verfugung. Um auf die Software, Daten und Dokumentation zuzugreifen, besuchen Sie www.smrtcommunity.com. Weitere Informationen zur neuen SMRT-Analysesoftware und dem PacBio RS High Resolution Genetic Analyzer finden Sie unter www.pacificbiosciences.com. Uber Pacific Biosciences Pacific Biosciences of California, Inc. (Nasdaq:PACB) hat den PacBio(R) RS High Resolution Genetic Analyzer im Angebot, der Wissenschaftler beim Losen genetisch komplexer Probleme unterstutzt. Basierend auf seiner neuartigen Technologie Single Molecule, Real-Time (SMRT(R)) ermoglichen die Produkte des Unternehmens: die gezielte Sequenzierung, um genetische Variationen umfassender charakterisieren zu konnen; die De-novo-Assemblierung von Genomen, um genomische Strukturen vollstandiger identifizieren, kommentieren und entschlusseln zu konnen, sowie die DNA-basierte Identifizierung von Anderungen, um epigenetische Regulierungen und DNA-Schaden besser charakterisieren zu konnen. Indem Pacific Biosciences Zugang zu Informationen ermoglicht, die zuvor nicht zuganglich waren, konnen Wissenschaftler ihr Verstandnis biologischer Systeme verbessern. KONTAKT: Presse: Maurissa Messier Fur Pacific Biosciences +1 760.539.7417 maurissa@bioscribe.com Investoren: Trevin Rard Pacific Biosciences +1 650.521.8450 ir@pacificbiosciences.com News Source: NASDAQ OMX 30.01.2013 Veröffentlichung einer Corporate News/Finanznachricht, übermittelt durch die DGAP - ein Unternehmen der EquityStory AG. Für den Inhalt der Mitteilung ist der Emittent / Herausgeber verantwortlich. Die DGAP Distributionsservices umfassen gesetzliche Meldepflichten, Corporate News/Finanznachrichten und Pressemitteilungen. DGAP-Medienarchive unter www.dgap-medientreff.de und www.dgap.de --------------------------------------------------------------------------- Sprache: Deutsch Unternehmen: Pacific Biosciences of California, Inc. Vereinigte Staaten von Amerika Telefon: Fax: E-Mail: Internet: WKN: Ende der Mitteilung DGAP News-Service ---------------------------------------------------------------------------
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